Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smim23Q9DAL0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim23Q9DAL0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim23Q9DAL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms