Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA19

Cir1, Corepressor interacting with RBPJ 1, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cir1Q9DA19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cir1Q9DA19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cir1Q9DA19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms