Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldnd2Q9D9H2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldnd2Q9D9H2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldnd2Q9D9H2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms