Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Speer4bQ9D9F7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Speer4bQ9D9F7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Speer4bQ9D9F7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4bQ9D9F7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms