Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx5Q9D8U8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx5Q9D8U8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms