Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp5Q9D7S9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp5Q9D7S9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp5Q9D7S9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp5Q9D7S9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms