Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capns2Q9D7J7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capns2Q9D7J7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capns2Q9D7J7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms