Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop56Q9D6Z1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop56Q9D6Z1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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