Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Borcs6Q9D6W8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Borcs6Q9D6W8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Borcs6Q9D6W8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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