Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc9bQ9D6E4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9bQ9D6E4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms