Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt34Q9D646 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt34Q9D646 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms