Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spsb1Q9D5L7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spsb1Q9D5L7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spsb1Q9D5L7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms