Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc7Q9D541 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc7Q9D541 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc7Q9D541 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc7Q9D541 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms