Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc130Q9D516 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc130Q9D516 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc130Q9D516 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms