Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrameQ9D4Z5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrameQ9D4Z5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrameQ9D4Z5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms