Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930556J24RikQ9D4U7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms