Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lonrf3Q9D4H7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lonrf3Q9D4H7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lonrf3Q9D4H7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms