Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933402E13RikQ9D4D2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933402E13RikQ9D4D2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933402E13RikQ9D4D2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933402E13RikQ9D4D2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933402E13RikQ9D4D2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933402E13RikQ9D4D2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933402E13RikQ9D4D2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933402E13RikQ9D4D2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms