Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syce1Q9D495 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce1Q9D495 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms