Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt20Q9D312 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt20Q9D312 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt20Q9D312 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms