Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps33aQ9D2N9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps33aQ9D2N9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps33aQ9D2N9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms