Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fndc8Q9D2H8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc8Q9D2H8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fndc8Q9D2H8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms