Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Batf3Q9D275 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Batf3Q9D275 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Batf3Q9D275 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms