Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo1Q9D1T0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lingo1Q9D1T0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lingo1Q9D1T0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms