Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpm3Q9D1Q4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dpm3Q9D1Q4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dpm3Q9D1Q4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dpm3Q9D1Q4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpm3Q9D1Q4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dpm3Q9D1Q4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms