Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Necap2Q9D1J1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Necap2Q9D1J1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms