Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Susd3Q9D176 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Susd3Q9D176 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Susd3Q9D176 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms