Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem53Q9D0Z3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259 ms