Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc47Q9D024 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc47Q9D024 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc47Q9D024 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms