Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prelid3bQ9CYY7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prelid3bQ9CYY7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms