Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
3100002H09RikQ9CXW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
3100002H09RikQ9CXW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
3100002H09RikQ9CXW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms