Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PmpcbQ9CXT8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PmpcbQ9CXT8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PmpcbQ9CXT8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms