Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nip7Q9CXK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nip7Q9CXK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nip7Q9CXK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nip7Q9CXK8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nip7Q9CXK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms