Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmd8Q9CX56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmd8Q9CX56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmd8Q9CX56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms