Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smyd3Q9CWR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smyd3Q9CWR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smyd3Q9CWR2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms