Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sppl3Q9CUS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sppl3Q9CUS9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sppl3Q9CUS9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms