Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930553M12RikQ9CUH1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4930553M12RikQ9CUH1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930553M12RikQ9CUH1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930553M12RikQ9CUH1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms