Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NmbQ9CR53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NmbQ9CR53 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms