Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska2Q9CR46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska2Q9CR46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms