Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vta1Q9CR26 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vta1Q9CR26 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vta1Q9CR26 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vta1Q9CR26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms