Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pam16Q9CQV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pam16Q9CQV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pam16Q9CQV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms