Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PompQ9CQT5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PompQ9CQT5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PompQ9CQT5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms