Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DenrQ9CQJ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DenrQ9CQJ6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DenrQ9CQJ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DenrQ9CQJ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
DenrQ9CQJ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DenrQ9CQJ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DenrQ9CQJ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DenrQ9CQJ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms