Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Med4Q9CQA5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Med4Q9CQA5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Med4Q9CQA5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Med4Q9CQA5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Med4Q9CQA5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Med4Q9CQA5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Med4Q9CQA5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Med4Q9CQA5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms