Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpa3Q9CQ71 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpa3Q9CQ71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms