Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
StambpQ9CQ26 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StambpQ9CQ26 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms