Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nsmce3Q9CPR8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsmce3Q9CPR8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms