Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl17Q9CPR4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl17Q9CPR4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl17Q9CPR4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms