Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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