Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc24a3Q99PD7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc24a3Q99PD7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc24a3Q99PD7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms